RESEARCH DESCRIPTION

Project Name: การอนุมานลักษณะการควบคุมการแสดงออกของยีนจากข้อมูลดีเอ็นเอไมโครอะเรย์ด้วยเทคนิคเบย์เซียนเน็ตเวิร์คและมาร์คอฟเชนมอนติคาร์โล (Inference of Gene Regulatory Network from DNA Microarray Data using Bayesian Network and Markov Chain Monte Carlo)

Researcher: Jeerayut Chaijaruwanich

Organization:Science/Computer Science

Time:1 October 2006 - 30 September 2007

RESEARCHER

  1. Jeerayut Chaijaruwanich (Head of project)

BUDGET

  1. BioMedical Engineering Center 100,000 Baht

ABSTRACT

ในสายลำดับดีเด็นเอของเซลลสิ่งมีชีวิตจะประกอบด้วยยีนที่ทำหน้าที่สร้างโปรตีนและเอนไซม์ชนิดต่างๆที่จำเป็นต่อการดำรงชีพ อาทิ โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมกระบวนการชีวเคมีที่เกิดขึ้นภายในเซลล โปรตีนที่เกี่ยวข้องกับการควบคุมการส่งผ่านเมตาโบไรต์เข้าออกเซลล์ เป็นต้นโดยทั่วไปการแสดงออกของยีนเพื่อสร้างโปรตีนจึงเกิดขึ้นเมื่อมีสิ่งเร้าและถูกควบคุมจากโปรตีนปจจัย(Regulatory Proteins) ตางๆ ที่เกิดขึ้นภายในเซลล์ เช่น ทรานสคริปทชันแฟกเตอร (Transcription Factors) แอกทิเวเตอร (Activators)โคแอกทิเวเตอร (Co- Activators) และ รีเพร็ซเซอร์ (Repressor) เปนตน ภายใต้สภาวะที่เหมาะสม ยีนจะทําการสําเนารหัสพันธุกรรม (Transcribe) เปน อารเอ็นเอ (RNA) และถูกแปลรหัสพันธุกรรม (Translate) เพื่อให้ได้สายลำดับเป็ปไตด์และเปลี่ยนรูปไปเป็นโปรตีนและเอ็นไซม์ที่มีโครงสร้างซับซ้อนต่อไป [1]
เราสามารถวัดระดับการแสดงออกของยีนไดดวยเทคโนโลยีดีเอ็นเอไมโครอารเรย ซึ่งสัญญาณตัวบงบอกวายีนมีการตอบสนองตอสิ่งแวดลอมมากนอยเพียงใด โดยทั่วไปเราจะวัดการแสดงออกของยีนเพื่อศึกษาพฤติกรรมการตอบสนองของเซลล์ภายใตสภาวะหนึ่ง ซึ่งในการแสดงออกของยีนหนึ่งๆอาจจะมีการแสดงออกกลุมของโปรตีนที่เกี่ยวของกับการควบคุมการแสดงออกของยีนนั้นๆร่วมดวย การศึกษากลไกการควบคุมการแสดงออกของยีนจึงมีความสําคัญเป็นอย่างยิ่งต่อความเข้าใจชีววิทยาของเซลล์สิ่งมีชีวิต